品种是工业辣椒产业高质量发展的核心基石，随着基因编辑、分子标记辅助育种等前沿技术的突破，工业辣椒育种已从传统表型选择迈入精准分子育种新时代。这一变革不仅大幅缩短了育种周期，更实现了对辣椒素含量、抗病性、适应性等关键性状的定向改良，为不同产区、不同加工需求提供了定制化品种解决方案。
基因编辑技术的应用是工业辣椒育种的重大突破。通过CRISPR-Cas9基因编辑系统，科研人员可精准定位并修饰与辣椒素合成、抗病性相关的基因。例如，针对工业辣椒核心需求的辣椒素含量性状，通过编辑CS基因家族（辣椒素合成关键基因），可培育出辣椒素含量在2.0%以上的高辣品种，或满足特殊加工需求的低辣、无辣品种。在抗病育种中，通过编辑感病基因，可显著提升品种对疫病、炭疽病、病毒病等常见病害的抗性，减少农药使用，契合绿色种植理念。相较于传统育种3-5年的周期，基因编辑技术可将育种周期缩短至1-2年，大幅提升育种效率。
分子标记辅助育种技术则为精准选种提供了科学依据。科研人员通过挖掘与目标性状紧密连锁的分子标记，可在幼苗期快速筛选出携带优良性状的单株，避免了传统育种中需等到成熟期才能进行性状鉴定的弊端。例如，贵州省农科院辣椒研究所通过分子标记技术，精准筛选出独杆性状的种质资源，培育出一次性采收品种“辣研102”，为全程机械化种植奠定了品种基础。同时，该技术还可实现多性状聚合育种，将高辣、抗病、耐旱、耐密等优良性状集中于一个品种，如新疆培育的“红龙23号”，通过分子标记辅助选育，兼具高辣椒红素含量（25g/kg）和强耐旱性，完美适配戈壁滩种植环境。
抗逆品种的定向培育是应对极端气候和特殊环境的关键。面对全球气候变化带来的高温、干旱、盐碱化等挑战，科研人员通过基因挖掘与定向改良，培育出一系列抗逆性突出的品种。在干旱少雨的北方产区，通过导入抗旱基因，培育的品种可在年降水量不足200毫米的地区实现稳产；在西南喀斯特山地，培育的“干鲜兼用”品种，可适应“十里不同天”的复杂气候，兼具鲜食和加工价值，延长上市周期，降低市场风险。此外，针对规模化种植需求，矮化、紧凑株型品种的培育，为密植栽培和机械化采收提供了可能，进一步提升了种植效益。
前沿育种技术的落地离不开种质资源库的支撑。目前，我国已建立起包含数千份辣椒种质资源的基因库，通过全基因组测序技术，完成了核心种质的基因图谱绘制，为精准育种提供了丰富的基因资源。未来，随着多组学技术（基因组、转录组、代谢组）的深度融合，工业辣椒育种将实现从“定向改良”向“设计育种”的跨越，培育出更多兼具优质、高产、抗逆、专用特性的突破性品种，为产业升级提供核心动力。
